La religion des Minoens reste, comme leur écriture, mal connue. L'ancien peuple de Crète honorait, semble-t-il, une divinité féminine, une déesse-mère qui pouvait prendre différent aspects, à moins qu'il ne s'agisse de plusieurs déesses distinctes... Ils vénéraient peut-être aussi certains animaux, comme le taureau dont on a retrouvé de nombreuses représentations (statuettes, peintures, ...) sur les sites minoens.

    Des sanctuaires étaient aménagés dans les palais, dans les villes et aussi au sommet de collines ou de montagnes. Les Minoens y déposaient des offrandes pour des divinités que l'on ne connaît pas et y pratiquaient des sacrifices d'animaux. Les archéologues ont découvert, dans les sanctuaires minoens, un grand nombre d'objets parmi lesquels des doubles haches qui étaient peut-être des symboles religieux.

    Les Minoens leur faisaient de fréquentes offrandes sous forme de nourriture, de statues et d'objets divers. On pense qu'ils ont dû pratiquer le sacrifice humain à une époque.

    Une légende célèbre rapporte qu'un Minotaure, mi-homme, mi-taureau, vivait dans un labyrinthe sous le château. Des jeunes gens lui étaient sacrifiés chaque année. Le grand prêtre ou le roi portait peut-être un masque de taureau pour le sacrifice, créant l'illusion d'un homme-taureau.

    Les Minoens croyaient dans l'au-delà et enterraient leurs morts avec de la nourriture et des biens qui pourraient leur faire usage. Les cornes de taureau et la hache à double tranchant constituaient des symboles sacrés.

    Aux alentours de 2000 av. J.-C., les Minoens inventèrent une écriture fondée sur un système hiéroglyphique, peut-être consécutivement à leurs contacts commerciaux avec les Égyptiens. Vers 1900 av. J.-C., ils avaient mis au point un nouveau mode de transcription, connu aujourd'hui sous le nom de Linéaire A. Un troisième système, le Linéaire B, entra en usage à Cnossos vers 1450 av. J.-C. À l'heure qu'il est, seul le Linéaire B a été déchiffré mais, dans leur grande majorité, les exemples qui nous sont parvenus contiennent assez peu de révélations sur cette civilisation et son histoire.

    La vie quotidienne des Minoens était agréable et relativement exempte de guerres et de troubles, ainsi qu'en témoignent la richesse et l'exubérance de leurs fresques, des peintures murales et des objets décoratifs.

    Les Minoens décoraient leur palais de magnifiques fresques aux couleurs vives. Ils aimaient les motifs végétaux, fleurs et feuillages, et représentaient des animaux réels (oiseaux, taureaux, singes,...) ou fantastiques (griffons, sphinx,...), des hommes vêtus de pagnes et des femmes au teint clair, habillées de longues robes qui laissaient leur poitrine dénudée.

    De nombreux artistes et artisans spécialisés travaillaient dans la riche Crète minoenne : des sculpteurs qui réalisaient de belles statuettes en bronze, en pierre ou en ivoire ; des potiers, dont les productions, très variées et réputées, se vendaient jusqu'en Égypte ; des orfèvres qui créaient de luxueux bijoux en or et taillaient des pierres semi-précieuses, comme la coraline rouge, pour en faire des bagues, des intailles (petits objets gravés d'un décor en creux),...

    Les objets d'art retrouvés représentent les Crétois pratiquant le « saut de taureau ». La signification de cette activité nous est inconnue. Des jeunes gens et des jeunes filles approchent un taureau en train de charger, l'attrapent par les cornes et exécutent un saut périlleux sur le dos de l'animal pour atterrir derrière lui.

    Les Minoens n'avaient apparemment guère besoin d'une armée, et comptaient plutôt sur leur flotte pour empêcher toute intrusion ennemie. Ils n'ont jamais fortifié leurs villes.

    En fait de navire, ils possédaient des galères, manœuvrées par des rameurs alignés sur les côtés. Ces embarcations étroites, rapides et très maniables, leur permettaient de dépasser les bateaux à voile, plus lents. Si l'on en croit les traces retrouvées sur des objets d'art, ils n'employaient pas de béliers à cette époque.

    Vers 1450 av. J-C., une nouvelle fois, tous les palais de l'île, sauf Cnossos, furent détruits, incendiés, et de nombreux sites ravagés. Que s'est-il passé ?  Les archéologues ont trouvé en Crète de nombreux indices qui montrent que, après la ruine des palais, l'île a été occupée, au moins en partie, par des Mycéniens. Ce sont eux, peut-être qui se sont installés à Cnossos, ont mis fin à la civilisation brillante et originale des Minoens.

    Les Grecs ont beaucoup appris de la civilisation minoenne, dans différents domaines comme l'art, les techniques artisanales (pour la fabrication des poteries, notamment), la culture de la vigne et de l'olivier, et la navigation.

    Les Minoens sont restés dans l'histoire pour leur fabuleux palais de Cnossos et les fresques qu'il renferme, en partie restaurés aujourd'hui. Ce fut sans doute le plus grand et le plus beau palais de la fin de l'Âge du bronze.

    Les Minoens ont également laissé leurs écrits mystérieux, dont certains continuent à défier les linguistes.